Современный костел в Пакутувенай построен в 1941–1943 гг. по инициативе местных жителей – сестры и брата Юстины и Юозапаса Стропасов, а также настоятеля Плунгеского прихода прелата Повиласа Пукиса.

В 1941 г. кретингский инженер Йонас Зубкус подготовил план костела. Плунгеская комендатура выделила 600 мешков цемента для заливки пола, по просьбе настоятеля бургомистр Плунге Эдвардас Мисявичюс передал для строительства 1200 мешков цемента, оставленного русскими, и 27 железных балок.

Пакутувенский костел спланирован прямоугольным, длиной 24 м и шириной 12 м. 26 сентября 1943 г. епископ Тельшяйской епархии Винцентас Борисявичюс торжественно освятил новый храм. Сначала в нем установили три алтаря, но остался только один.

Костел классицистического стиля, в настоящее время находится в ведении братьев-францисканцев.