Der Beginn des Ensembles der Kirche der unbefleckten Empfängnis in Alsėdžiai datiert im vierzehnten Jahrhundert, als die erste Kirche errichtet wurde. Allerdings ist weder diese, noch der Nachfolger aus dem siebzehnten Jahrhundert erhalten, denn die heutige Kirche wurde erst siebzehnhundertdreiundneunzig vollendet.

Die Kirche hat die Gestalt einer Basilika, ist aus Holz in der für Niederlitauen typischen Form einer Pyramide errichtet. Das Mittelschiff hat ein massives Satteldach, während die Apsis ein Walmdach hat. Kulturell von besonderer Bedeutung sind die Holzschnitzereien und mit Gemälden geschmückten sieben Altäre der Kirche.